В ProxMox 5 и 6 файлы конфигурации контейнеров переехали в /etc/pve/lxc.
А файлы конфигураций виртуальных машин в ProxMox 5 лежат в директории /etc/pve/qemu-server/.

Proxmox 2.x

Файлы конфигураций машин qemu лежат в папке:

/etc/pve/nodes/proxmox/qemu-server/

Файлы конфигураций контейнеров OpenVZ лежат в папке:

 /etc/vz/conf/

В этих папках лежат файлы *.conf, а в файлах лежат все параметры виртуальных машин.